三位超能小女警拥有无与伦比的超级力量，她们在睡前打击犯罪，用自己的“女孩力量”守护家园和身边的小镇居民们。

飞天小女警讲述三位拥有神奇力量的罪恶克星花花、泡泡及毛毛拯救世界的故事。

绝大部分的故事都发生在美国一个名为小镇村（The City of Townsville）的都市，飞天小女警则是这座城市的保护者，举凡阻止银行抢案、火场救援、防止怪兽破坏城市等，都是她们的工作[2]。 飞天小女警对付犯案者及怪兽毫不留情，几乎总是会狠狠的揍他们一顿，再把他们丢进监狱或交给警方。

飞天小女警有专属的热线电话，市政厅、小橡树幼儿园和飞天小女警家里都设有分机。发生犯罪事件时通常是由市长打电话通知飞天小女警。飞天小女警的主旨是「英雄不是绝对的善，坏蛋也不是绝对的恶…因为每个人都有好的本性和坏的本性，只看你怎么选择。」

结尾画面和结尾语也是本作的特色，各故事都有结尾画面和结尾语。大部分的结尾画面为飞天小女警三人，结尾语通常则是「一天又平安的过去了，感谢飞天小女警的努力！」但前两者并非每集都是一成不变；较可能出现的会是解决该集纷争最有助力的人、事、物，而也并非绝对单一个体（也可能是好几个）。